No ano de 2071, a rotina da tripulação da nave Bebop é bruscamente interrompida por um ataque bioterrorista em Marte. Durante uma caçada de rotina, Faye Valentine testemunha a explosão de um caminhão-tanque que libera um patógeno mortal, dizimando centenas de pessoas e mergulhando a cidade em caos. Com uma recompensa astronômica pela cabeça do culpado, Spike, Jet, Faye e Ed decidem investigar o caso.

O que parecia ser apenas uma oportunidade de lucro fácil se revela uma conspiração complexa envolvendo uma poderosa corporação farmacêutica e um passado sombrio que ameaça o futuro da colônia marciana. Enquanto o tempo corre, os caçadores de recompensas precisam desvendar a verdade por trás do vírus antes que o terrorismo atinja proporções irreversíveis durante as celebrações de Halloween.