Os três irmãos descobrem que o experimento humano, banido após a destruição do 'Orochi', ainda está em andamento para reviver secretamente a serpente maligna. Eles também descobrem que alguns ex-membros da Yamainu (a unidade militar japonesa formada para eliminar a serpente) estão por trás dessa conspiração. Os irmãos se unem novamente em uma batalha contra os militares.