O mundo virtual dentro do scub coral (formas de vida inteligentes semelhantes a corais) criado por Eureka... As pessoas daquele mundo virtual apareceram na Terra há dez anos, quando ele entrou em colapso. Desde essa amálgama em larga escala, os humanos do mundo virtual se autodenominam "Terra Verde" e os humanos originais da Terra se chamam "Terra Azul", e têm causado diversos conflitos uns com os outros repetidamente sob a superfície. Eventualmente, Dewey Novak, um oficial sênior das Forças Armadas da Terra Verde, ascende junto com seus camaradas e finalmente coloca em prática um plano de terrorismo em larga escala para proteger a própria dignidade deles. Enquanto isso, Eureka, que é detestada pelo mundo como a principal causa do caos, tornou-se uma combatente de alto nível na unidade A.C.I.D. da ONU. Viver para manter este mundo em paz... Este foi o caminho de expiação que ela escolheu. Um dia, ela recebe a ordem de proteger uma garota chamada Iris, uma nova "Eureka" que possui a habilidade de controlar o scub coral. Elas brigam muito no início, mas gradualmente passam a se entender durante sua fuga solitária. Em breve, o mundo enfrenta uma crise, e quando isso acontece, Eureka usa cada gota de sua força enquanto luta. "Eu quero proteger Iris e este mundo." Que futuro a aguarda no final desse desejo dela?