Futari Ecchi conta a história de Makoto e Yura, que seriam um casal comum, se não fosse por um detalhe: casaram-se virgens com 25 anos de idade. Ele não sabe direito o que fazer, ela tem vergonha (e não sabe o que fazer também). O título Futari Ecchi (futari de duas pessoas e ecchi de sexo) é um trocadilho com Hitori Ecchi, que significa masturbação.