Disfarçada de menino, a jovem Chizuru Yukimura deixa seu lar tranquilo e segue para Kyoto em busca de seu pai desaparecido — um médico chamado Koudou. Ela logo descobre que a volátil capital é um lugar perigoso, sendo emboscada por um par de ronin nas ruas. Para seu horror, os ronin são mortos bem diante de seus olhos por samurais de cabelo branco e olhos vermelhos, apenas para serem rapidamente eliminados por três homens do Shinsengumi — uma força policial especial que serve ao shogun. Após o incidente, Chizuru é levada sob custódia pelo Shinsengumi para mais interrogatórios. Ao saber que seu pai desaparecido é também o mesmo homem que eles procuram, o chefe permite que ela permaneça sob seus cuidados enquanto buscam seu paradeiro. Enquanto trabalha como assistente para o segundo em comando, Toshizou Hijikata, Chizuru descobre lentamente o quão conectados o problemático ambiente político de Kyoto e os samurais de cabelo branco com aparência demoníaca estão a ela.