Kobato é uma doce menina , mas também extremamente angelical sobre o mundo ao seu redor. Ela tem uma "missão", que consiste em preencher uma misteriosa garrafa dela com o sofrimento a partir o coração das pessoas assim o seu desejo de ir um certo lugar que ela queira ir pode ser concedida. Sua única restrição parece ser que ela não pode se apaixonar por um garoto especial que ela vai trabalhar para ela e cujo coração irá sarar.