Em um novo dia na região de Kanto, Ash é convidado pelo Professor Carvalho para a cerimônia de abertura do laboratório do Professor Sakuragi em Vermilion. Durante o discurso, o Professor Sakuragi recebe um alerta sobre um possível Pokémon raro aparecendo no porto da cidade, levando Ash e outros treinadores a correrem para a área na esperança de encontrar o misterioso Pokémon. No porto, eles encontram Lugia – um Pokémon Lendário – em combate com outros treinadores.

Percebendo as táticas dos outros treinadores, Ash ordena que seu parceiro, Pikachu, ataque Lugia com um Choque do Trovão. Imperturbável, Lugia foge, mas não antes de Ash pular em suas costas com determinação. Para surpresa de Ash, ele encontra outro garoto, Goh, que também pulou nas costas de Lugia. Os dois cavalgam em Lugia enquanto ele os leva em uma aventura bizarra pelos mares. Ao deixá-los de volta ao chão, Ash e Goh se despedem de Lugia e retornam ao Instituto Sakuragi.

Impressionado com as descobertas de Goh e a percepção de Ash durante o encontro, Sakuragi pede à dupla para serem seus novos parceiros de pesquisa. E assim começa a jornada da dupla, viajando por várias regiões para conhecer muitos novos Pokémon – incluindo aqueles com a habilidade de Gigantamax!