Ray The Animation tem como cenário um futuro próximo, e nos conta a historia de uma jovem garota que foi recolhida por uma instituição que visa vender os órgãos para o mercado negro de transplante de órgãos. Esta garota foi chamada de Ray por causa dos números (075-1-74), que são usados para identificá-la e, quando subtraídos, resultam em zero, em japonês a palavra “Rei” seria zero. Depois ter seus olhos vendidos Ray é resgatada por Black Jack, um medico do submundo que com o auxilio do Dr. Kasugano devolvem a visão para Ray equipando-a com um “olho” chamado X-Ray. Após esse fato ela decidi viver a vida dela como ela quiser. Dez anos depois Ray se torna uma grande e respeitada cirurgiã por suas habilidades únicas.