Na primavera de 1998, na cidade de Yomiyama, Kouichi Sakakibara deveria começar as aulas em uma nova escola. Infelizmente, ele está internado no hospital devido a um pulmão colapsado. Enquanto perambula pelo hospital, ele conhece uma garota de cabelos escuros chamada Mei Misaki, que veste o uniforme de sua nova escola, um encontro casual e inocente que terá mais repercussões do que ele imagina. Quando Sakakibara finalmente consegue frequentar as aulas na Escola Secundária do Norte de Yomiyama, ele percebe que seus colegas de classe tratam Misaki como se ela não existisse. Ele tenta desvendar o mistério em torno dela, mas o comportamento de seus colegas se torna ainda mais estranho. E quando colegas da Turma 3-3 inexplicavelmente começam a morrer de formas horríveis, Sakakibara começa a questionar a ligação entre Misaki e o crescente número de mortes.