Suzaku Kururugi, um soldado britaniano, é baleado por desobedecer a uma ordem de executar seu amigo e terrorista acusado, Lelouch Lamperouge. Felizmente, ele sobrevive à tentativa de execução, acordando na divisão de pesquisa do Império. Descobre-se que Suzaku foi escolhido como o principal candidato a testes para o Lancelot, um novo e poderoso mecha de combate que aumenta exponencialmente a destreza física de seu usuário. Diante da chance de mudar o mundo para melhor, ele concorda em se tornar o primeiro piloto do Lancelot. Code Geass: Hankou no Suzaku acompanha a luta desesperada de um jovem para proteger aqueles que lhe são mais queridos e derrotar a maior ameaça à paz de Britannia: o astuto e autoproclamado vigilante Zero.