Na Academia Kamome, os corredores sussurram sobre os Sete Mistérios, lendas urbanas que ganham vida nas sombras. Nene Yashiro, uma estudante apaixonada por ocultismo e desesperada por um romance, decide invocar Hanako-san, o espírito que habita o banheiro feminino do terceiro andar, acreditando que ele pode realizar seus desejos amorosos. Contudo, ao abrir a porta, ela não encontra uma garota, mas um garoto travesso e enigmático.

Após um incidente envolvendo uma escama de sereia que sela seus destinos, Nene é forçada a se tornar assistente de Hanako-kun. O que parecia ser apenas uma tentativa de conquistar o coração de seu crush transforma-se em um mergulho profundo nos segredos sobrenaturais da escola, onde Hanako atua como o guardião do equilíbrio entre o mundo dos vivos e o dos mortos.