Yuuta Okkotsu é assombrado. Desde que sua amiga de infância Rika morreu em um acidente de trânsito, o fantasma dela o acompanha. Mas seu espírito não aparece como a doce garota que Yuuta conheceu. Em vez disso, ela se manifesta como uma entidade monstruosa e poderosa que o protege ferozmente. Incapaz de controlar o comportamento violento de Rika, Yuuta é impotente para deter o derramamento de sangue que se segue à sua vingança brutal. Como resultado, quando apreendido por feiticeiros "Jujutsu" — os guardiões secretos do mundo, treinados para combater forças como Rika — Yuuta deseja ser completamente isolado para que ninguém mais se machuque. No entanto, seu apreensor, o mestre feiticeiro Satoru Gojou, tem planos diferentes para ele: ele se juntará à Escola Técnica Superior de Jujutsu da Prefeitura de Tóquio e aprenderá a controlar Rika para ajudar as pessoas. Agora, como aluno do primeiro ano nesta escola, Yuuta começa a aprender as artes Jujutsu e a combater seres malignos. Ao lado de seus novos colegas de classe Maki Zenin, uma especialista em armas Jujutsu; Toge Inumaki, um conjurador que usa suas palavras como armas; e Panda, um urso panda aparentemente ambulante e falante, Yuuta começa a encontrar seu lugar no mundo e, pela primeira vez, a se sentir confortável com suas habilidades. No entanto, à medida que seu treinamento avança, Yuuta descobre que os perigos do mundo Jujutsu vão muito além dos espíritos malignos.