Katou Narumi sofre da Síndrome de Zonapha, uma doença rara que interrompe sua respiração a menos que ele faça as pessoas rirem. Ele foi forçado a abandonar seu treinamento em kenpo chinês e retornar ao Japão, onde agora trabalha como palhaço. O único problema: ele não é muito engraçado. Um dia, ele conhece Saiga Masaru, o recente herdeiro de uma enorme fortuna, que lhe proporciona a primeira risada do dia. Ao perceber que Masaru está sendo perseguido por assassinos, Narumi intervém para proteger o garoto, apenas para descobrir que, em vez de armas convencionais, os assassinos empunham marionetes gigantes e sinistras. Eles logo encontram a misteriosa Shirogane, que controla sua própria marionete e afirma ter sido enviada da França pelo falecido avô de Masaru para protegê-lo. Seus caminhos se entrelaçam e se separam, dividindo-se em duas histórias: Karakuri e Circus, marionetes e artistas, lágrimas e risadas. O estranho circo de bonecas vivas que espalha a Síndrome de Zonapha, as marionetes humanas conhecidas coletivamente como Shirogane, e os mestres de marionetes cuja inimizade eterna deu início a ambos os lados dessa performance.