O Sargento Keroro é o Capitão da Equipe de Avanço Especial das Forças de Invasão Espacial do 58º Planeta do Sistema da Nuvem de Tempestade Gama. Ele foi enviado ao planeta Pokopen (também conhecido como Terra) para coletar informações para a força de invasão de seu planeta. Ele também é um sapo. Após sua nave cair na Terra, ele se abriga na casa da família Hinata, mas os dois irmãos, Fuyuki e Natsume, o encontram e confiscam suas armas alienígenas. Quando seu povo descobre que os pokopenianos estão cientes de sua presença, Keroro é abandonado, deixado para se virar neste mundo hostil. Mas ele não está sozinho: outros quatro agentes de pré-invasão também estão à espreita na Terra.