Hiiragi Utena sempre admirou garotas mágicas e fantasiou em se transformar em uma heroína legal que luta contra o mal. Então, quando uma figura semelhante a uma boneca se aproxima dela certa noite, alegando que ela possui um poder mágico adormecido em seu interior, ela treme de excitação. Mas seu sonho colorido é rapidamente estilhaçado em uma reviravolta irônica de eventos quando ela se transforma em uma vilã! Sem interesse em se associar com as forças do mal, ela tenta desistir quando um grupo de garotas mágicas aparece e declara guerra. Uma batalha se segue e Hiiragi logo descobre que ela gosta de infligir dor aos outros enquanto sua verdadeira natureza começa a emergir. Mahou Shoujo ni Akogarete acompanha Hiiragi enquanto ela começa sua nova vida como a líder de vilões, lutando contra garotas mágicas e se entregando à sua recém-descoberta natureza sádica à vontade.