No ano 0079 da Era Universal, a humanidade vive um conflito brutal entre a Federação Terrestre e o Principado de Zeon. Quando a colônia Side 7 se torna alvo de um ataque surpresa das forças de Zeon, o jovem Amuro Ray, um civil sem treinamento militar, acaba em meio ao fogo cruzado. Para proteger seus amigos e sobreviver, ele assume o controle do RX-78-2 Gundam, uma arma experimental da Federação que altera o curso da guerra.

Mais do que uma simples recontagem, o mangá expande o universo original ao explorar as motivações políticas e as tragédias pessoais que levaram ao conflito. A trama mergulha profundamente no passado de figuras centrais, como o enigmático piloto Char Aznable e sua irmã Sayla Mass, revelando as raízes do ódio entre as facções e o peso das escolhas que moldaram o futuro da humanidade no espaço.