Quando o solteiro Daikichi Kawachi comparece ao funeral de seu avô, ele se surpreende ao encontrar uma jovem misteriosa sozinha no jardim. Para sua surpresa, a garota tímida e reservada, chamada Rin Kaga, é considerada a filha ilegítima de seu falecido avô. Devido às circunstâncias vergonhosas relacionadas à menina, ninguém na família está disposto a acolhê-la após a morte de seu pai. Furioso com a frieza estendida a uma criança inocente, Daikichi anuncia que ele mesmo cuidará de Rin, apesar de sua pouca idade, estado civil de solteiro e falta de experiência parental. Usagi Drop acompanha a história de Daikichi e Rin enquanto eles tentam encontrar felicidade e propósito para seu encontro fatídico.