No ano de 2010, o mundo mudou drasticamente com a ascensão do Sagrado Império de Britannia, uma potência militar que subjugou o Japão, renomeando-o como Área 11. O povo japonês, agora privado de sua identidade e soberania, vive sob o controle opressor dos invasores. É nesse cenário de tensão que Lelouch Lamperouge, um estudante britaniano exilado, se vê no centro de um conflito armado entre as forças imperiais e a resistência local.

A vida de Lelouch toma um rumo definitivo ao encontrar C.C., uma garota misteriosa que lhe concede o Geass, o chamado "Poder dos Reis". Com a capacidade de impor obediência absoluta a qualquer pessoa, ele assume a identidade secreta de Zero. Sob essa máscara, ele lidera uma rebelião implacável, orquestrando estratégias brilhantes para desmantelar o Império de Britannia e buscar justiça por seu passado.