Os sonhos de Lelouch Lamperouge de destruir o Sacro Império da Britânia estão lentamente desmoronando. Sua irmã, Nunnally, foi sequestrada por Schneizel el Britannia, e Suzaku Kururugi está ignorando seus apelos desesperados por ajuda. Os Cavaleiros Negros estão perdendo a fé em Lelouch como seu líder, e a Federação Unida das Nações declarou guerra global à Britânia. Após sofrer inúmeras traições, uma perda significativa de poder e um ressentimento crescente em relação ao Imperador Charles zi Britannia, o debilitado Lelouch toma uma decisão final: se ele não conseguir destruir o Império por fora, ele o tomará para si por dentro.