Em um animado dia de dezembro na Ashford Academy, os estudantes estão alegremente se preparando para o festival escolar de amanhã. No entanto, as celebrações são abruptamente interrompidas quando terroristas atacam a academia. Os estudantes são feitos reféns e colocados sob confinamento enquanto remanescentes militantes da Federação Neo-Chinesa tomam o controle da escola. Mal sabem os agressores que, entre o corpo estudantil, estão aqueles com poderes extraordinários, incluindo Lelouch Lamperouge, portador do Geass, e o soldado Britanniano Suzaku Kururugi. Para proteger sua escola e restaurar a paz, Lelouch e o conselho estudantil devem se unir novamente para realizar um último milagre.