Gun Frontier é uma região árida e devastada onde os fracos não têm permissão para sonhar. É também uma terra sagrada para os homens verdadeiros, e não há lugar onde um ser humano possa se sentir mais vivo. O capitão Harlock e o samurai Tochiro chegam dos Estados Unidos pela fronteira ocidental, em busca de um clã perdido de imigrantes japoneses. Junto com uma mulher misteriosa que eles conheceram no caminho, irão andar por Gun Frontier de ponta a ponta até encontrarem o que procuram, desafiando bandidos..