Kaito Kuroba é um estudante comum do ensino médio, filho de Toichi Kuroba, um mágico genial que morreu em circunstâncias misteriosas. Kaito descobre que a identidade secreta do pai era a de um notório criminoso internacional conhecido como Kaitou Kid, o Ladrão Fantasma. Ele foi assassinado por uma organização por se recusar a ajudá-la a recuperar a “Pedra de Pandora”, uma pedra mística que, segundo a lenda, pode conceder imortalidade. Ele promete impedir que a organização obtenha a joia e assume a identidade secreta do pai como o Ladrão Fantasma.