Em uma versão alternativa do Japão feudal, o período Edo sofre uma reviravolta drástica quando alienígenas conhecidos como Amanto conquistam a Terra. Com a proibição do porte de espadas e a submissão do xogunato aos invasores, os samurais tornam-se figuras obsoletas. É nesse cenário caótico que surge Sakata Gintoki, um ex-guerreiro de cabelos prateados que, para pagar o aluguel, aceita qualquer trabalho como freelancer ao lado de seus companheiros, Shinpachi e Kagura.

O cotidiano do trio é um turbilhão de situações absurdas, paródias culturais e dilemas existenciais. Enquanto tentam sobreviver em um mundo que não respeita mais suas tradições, eles se envolvem com figuras excêntricas da cidade, equilibrando momentos de comédia escrachada com arcos dramáticos intensos que revelam as cicatrizes de um passado marcado pela guerra.