Transferido para a Academia Shujin, em Tóquio, Ren Amamiya está prestes a entrar no segundo ano do colegial. Após um certo incidente, sua Persona desperta, e junto com seus amigos eles formam os Ladrões-Fantasma de Corações, para roubar a fonte dos desejos deturpados dos adultos e assim reformar seus corações. Enquanto isso, crimes bizarros e inexplicáveis surgem um após o outro... Levando uma vida comum em Tóquio durante o dia e rondando a metrópole à noite... Ergam-se as cortinas para esta grande história picaresca!